其亲临喀什噶尔，译询卡外各国夷部地土风俗，离去之前，摘抄《喀什噶尔、巴尔楚克等城垦田原案摘略》《巴尔楚克等城垦田案略》《哈密厅卷宗》等手卷，获赠《卡外与图》，从历史地理中寻找“备边之法”
。
林则徐深知疆民之苦，坦言“回子至愚极懦，且极可怜。
自汉官以至兵丁，使唤之甚于犬马，其贸易放债之汉民，欺骗之、盘剥之，视若豕羊而已”
，规劝清廷重视善待。
其提出治边方略：其一，要防外夷入侵，必须屯田守边，尤其巴尔楚克，要广为开垦，使之成为边疆重镇；其二，要安定回民，改变民族偏见。
林则徐从安边富国的大局出发，驳斥回族会因“富强而生反侧”
的谬说，主张减轻粮税，招回分田，使贫穷回民得以安定，其塞防思想互为表里因果，“屯垦、屯边、固边”
层层递进。
林则徐海塞并重，有预见，为后续事变证实。
“海塞并重”
思想也在左宗棠和沈葆桢手中开枝散叶，影响深远。
而李鸿章对海防问题的看法，集中体现在他的万言《筹议海防折》上。
李鸿章深谙中国政经中心俱在东方，天然海洋屏障拱卫了财富，而鸦，片战争不仅震惊国人也震动国基。
其深知清廷国库空虚，提议在新疆采取守势，静观其变，运用以夷制夷，使英俄相互牵制，以待日后收复国土。
如此清廷就可拨西北军饷用作东南海防，壮大海军。
李鸿章强调新疆界于俄英印及波斯之间是敏感地带，清廷“饷力、人才实有不逮”
，应集力海防，暂缓塞防。
针对国内形势，李鸿章开出药方：变革奋起，其呼吁遵循实事求是，务实求真，兴办洋务。
对外惧战以求自强发展的和平环境，切不可逞意气孤注一掷，视国事为儿戏，内政不修，则“战守皆不足以恃，而可亦不可久也”
。
他说列强凭借海船火炮实为中国“数千年来未有之强敌”
，而中国仍“犹欲以成法制之”
，如患者不论何种疾病皆以古方治之，肯定不能见效。
因此他认为“居今日而欲整顿海防，舍变法与用人，别无下手之方”
。
其倡导“变”
是指军事制度变革，建立新型陆海军；改革旧式科考八股，培养新式科技人才，这点倒是很受吴可等有识封疆的赞同。
对李鸿章“暂缓西征、全力海防”
的观点，左宗棠竭力反对。
他认为新疆、蒙古和京师连为一体，新疆失守，连锁反应，危机京城。
因此他主张水陆并重，一边收复新疆，一边加强海防。
左宗棠分析当时国内外形势，认定是进军新疆的好时机。
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